По сообщению аудитора Владимира Катренко, распоряжением правительства РФ было предусмотрено осуществление в 2008-2011 годах проектирования, строительства и технического оснащения здания НИИ в Москве со сроком ввода в эксплуатацию в 2011 году и объемом финансирования в сумме 975,2 млн рублей. Позднее постановлением правительства РФ указанное распоряжение было признано утратившим силу. Было предусмотрено осуществить бюджетные инвестиции за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета общим объемом 4,8 млрд рублей в проектирование, строительство и техническое оснащение здания НИИ пульмонологии общей площадью 22 630,0 кв. м со сроком ввода в эксплуатацию в 2015 году.
Проверка показала, что в период 2008-2012 годов ФМБА были осуществлены расходы за счет средств федерального бюджета в общей сумме 212,4 млн рублей, в том числе в 2012 году — 22,4 млн рублей. Фактически за указанный период было освоено 22,3% объема средств, предусмотренного постановлением правительства.
Счетная палата указала также на отдельные нарушения действующего законодательства, выявленные в ходе проверки. Так, строительство здания НИИ пульмонологии велось при отсутствии соответствующего разрешения на строительство, работы выполнялись без утвержденной в установленном порядке проектно-сметной документации.
Также установлено, что ФМБА России в 2012 году не были использованы средства федерального бюджета в общей сумме 597,5 млн рублей, что является нарушением принципа результативности и эффективности использования бюджетных средств.
Коллегия приняла решение направить информационные письма в Федеральное медико-биологическое агентство, ФГУ «Научно-исследовательский институт пульмонологии». Отчет о результатах контрольного мероприятия направляется в палаты Федерального Собрания.